Токсин (др.-греч. (toxikos) — ядовитый) - вещество бактериального, растительного или животного происхождения, способное при попадании в организм человека или животных вызывать заболевание или их гибель.
Это из медицинской энциклопедии а не из тупого мультика.
Вообще я думал это синонимы, и как говорит учебник русского языка, синонимы могут отличаться оттенками значения, в данном случае можно получить следующее выражение токсичный >> ядовитый. Т.е. токсин это более сильный яд, а яд это слабый токсин.